CNNIC发布的最新中国互联网报告中的数据显示，网站数量虽然有所减少，但并不能简单地将这1万个新增的网站归因于小程序或独立APP的备案。实际上，网站数量的变化可能受到多种因素的影响，包括但不限于移动互联网的普及、建站门槛的提高、网站备案制度的严格以及搜索引擎算法的严格化等。
从移动互联网的普及来看，随着智能手机的普及和移动互联网的快速发展，用户更多地倾向于使用手机APP进行上网浏览，而非传统的电脑网站。这使得网站的访问量和使用频率逐渐下降，从而导致网站数量的减少。
此外，建站门槛的提高也是导致网站数量减少的原因之一。随着技术的进步和网站安全性的要求提高，建站所需的成本和技术难度也在逐渐增加。这导致一些个人或小型组织无法承担建站的成本和技术要求，从而放弃了建站。
同时，网站备案制度的严格也是影响网站数量的重要因素。近年来，国家对于网站备案的要求越来越严格，不仅审核时间变长，对于内容和监管的要求也更加严格。这使得一些网站因为无法完成备案或无法通过审查而被迫关闭。
另外，搜索引擎算法的严格化也是导致网站数量减少的原因之一。随着搜索引擎对于网站质量和内容的要求提高，一些质量不高或存在违规行为的网站被搜索引擎降权或封禁，从而导致网站数量的减少。
至于你提到的网站商业体系崩塌的问题，这确实是一个值得关注的现象。随着网站数量的减少和相关岗位的减少，整个网站的商业体系可能正在经历一场变革。然而，这并不意味着整个行业都将消失或无法发展。相反，这可能会促使行业进行更加深入的创新和调整，以适应新的市场需求和发展趋势。
总之，网站数量的减少是一个复杂的现象，受到多种因素的影响。我们需要从多个角度进行分析和探讨，以更好地理解这一趋势并做出相应的调整。同时，我们也需要关注网站商业体系的变化，并积极寻找新的发展机遇和商业模式。